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芝加哥大学博士蛋白质组学领域创业,获碧桂园

来源:投资与创业 【在线投稿】 栏目:综合新闻 时间:2022-06-15
作者:网站采编
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摘要:蛋白质组研究可以为疾病标志物的筛选、临床试验病人分层、药效评估和监测、疾病机制研究、植物抗逆机理研究、发育机制研究等方向提供技术手段,为精准医疗、药物靶点研究、药

蛋白质组研究可以为疾病标志物的筛选、临床试验病人分层、药效评估和监测、疾病机制研究、植物抗逆机理研究、发育机制研究等方向提供技术手段,为精准医疗、药物靶点研究、药效分析等提供支持。

具体到蛋白质组,过去都是使用抗体或者类似物,一个一个地去捕捉蛋白质,研究其功能。即研究人员假设发现了一种蛋白质,之后针对这种蛋白质设计抗体,再对蛋白质进行抓取,最后验证抓取的蛋白质是否与假设一致。

于是从2016年左右开始,行业出现了新一代蛋白质组公司,主要集中在美国和欧洲。这些公司并不预设假设,而是更关心如何呈现蛋白质组的全貌。他们做的事情是将蛋白质的数据尽可能地都抓出来,珞米生命科技也是其中之一。

该平台主要涉及的环节有:基于人工智能和分子模拟筛选蛋白质亲合体;通过3D微流控平台高通量合成纳米探针;利用智能自动化样本处理工作站实现高通量标准化采集数据;经过AI驱动生信平台完成大数据分析,并指导湿实验的开展。湿实验得到的数据最终也会用来调整算法,使其算法越来越准确。

但这种研究范式的局限性在于研究者观察到的所谓“事实”是高度不确定的,受研究者自身研究水平、实验条件、实验预期等主客观因素影响,其假设的“事实”可能是片面的。

针对目前蛋白质组学上游存在的痛点问题,珞米生命科技自主研发了基于纳米工程、微流控、人工智能的技术平台,实现计算和实验闭环,该平台可以系统性地设计、合成和筛选数万种具有独特物理结构的纳米探针,实现从单一样本中同时捕捉和检出丰度跨越10个数量级的上千种蛋白质,并且通过筛选不同纳米探针的组合,有望能够高通量地搜寻和访问整个蛋白质组物理空间。

我们对基因的了解已经很深入:从2001年人类基因组计划发布第一张人类基因组草图,到2021年公布第一张完整人类基因组图谱。

吴昊在芝加哥大学获得工程博士学位,师从美国三国院士,拥有多学科交叉背景。其博士课题受到美国材料基因组计划支持,这是一个由时任美国总统奥巴马发起的,旨在通过大数据和人工智能来发现更多功能性材料的科研计划。吴昊博士表示,虽然最终的应用不一样,但是Nanomics现在做的事情与其博士研究经历,整体的方法学高度一致。

美国生物学家Todd Colub在发表于《Nature》的一篇文章中提到,“在获得全局的基因数据之前,人们难以区分信号与噪音。”人类基因组计划开启了数据驱动的科学研究范式, 那以百万为计量单位的蛋白质组,也将遵循数据驱动的研究范式,珞米生命科技创始人(Nanomics)创始人兼CEO吴昊认为。

第二,相比于基因组,蛋白质组层面的信息更能全面地反应疾病状态。

如果将人体的细胞煮沸,只有四种物质:基因、蛋白质、脂质和碳水化合物。相对而言,脂质和碳水化合物比较简单,也不容易出错,剩下最重要的就是基因和蛋白质。

珞米生命科技成立于2021年,是一家人工智能和蛋白质组学大数据驱动的精准医学公司,主要通过其独创的新一代数字化蛋白质组学平台Kepler Pro开发海量纳米探针,实现高通量、大规模地富集蛋白质组数据,继而加速蛋白质生物标记物发现、临床病人分层、药物开发、疾病早筛诊断的应用。该平台预计将于年底搭建完成,第一代试剂盒与自动化设备预计将于明年初开始销售。

第一,越来越多的证据表明基因转录的数量与蛋白质丰度之间没有线性关系,具体来说,即便基因决定了蛋白质,但基因的数量难以决定蛋白质的数量,这意味着即便检测出了人类的基因组,但也难以了解蛋白质组。

关于人类蛋白质组计划的开始,吴昊博士认为有两个底层原因。

珞米生命科技的该平台预计将于年底搭建完成,第一代试剂盒与自动化工作站预计将于明年初开始销售。

在吴昊看来,对于处于更早期的蛋白质组学来说,其发展也会遵循类似路径:先要有能将上游赋能工具做好的公司。这是现阶段制约蛋白质组学从科研走向临床的核心瓶颈,包括了半导体、纳米材料、微流控等所谓的“卡脖子“技术。上游工具也是现阶段欧美蛋白质组学公司布局最多的地方。据吴昊介绍,目前看到国内蛋白质组学公司,更多的是选择去做科研服务或者临床应用。


文章来源:《投资与创业》 网址: http://www.tzycyzz.cn/zonghexinwen/2022/0615/2842.html



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